透過運動會帶來許多好處，運動治療慢性疼痛的機轉如下：

產生內源性嗎啡：運動後腦部可產生內啡、蛋氨酸腦啡呔、內源性大麻素等止痛物質。
產生血清素轉運體：作用在腦組織鴉片接受器中，對情緒、記憶和疼痛皆有助益。
減少前驅性發炎細胞素：如腫瘤壞死因子α、介白質-6、介白質1β等，減少發炎。
增加抗發炎細胞素：如介白質-10。
釋放肌肉激素：如鳶尾素，能促進肌肉強壯和骨質堅固。
增加調節性T細胞：可抑制免疫反應，降低發炎，改善疼痛。