部分葡萄糖胺產品可能由蝦蟹殼萃取，若是對這類海鮮過敏者需注意，食用該產品有可能引發過敏反應；而有些葡萄糖胺產品含有鈉鹽量較高，有心血管疾病的患者，應該注意攝取量。葡萄糖胺產品可能造成的副作用多屬於輕微的腸胃道副作用，如噁心、胃灼熱、腹瀉、便祕等，少數人會出現頭痛、嗜睡跟皮膚過敏的症狀。