大腦白質稀疏症由於影響的是神經傳導束，因此負責不同功能的各個區域之間的溝通就會出現障礙，導致大腦的正常功能無法發揮。其中影響最大的是認知能力與動作協調。與認知能力受損有關的影響包括計畫、設定優先順序、風險評估、專注與決策的能力，而與動作協調受損有關的則包括平衡與步態等。