柔佛在1586年發動水陸大軍圍攻馬六甲。1587年，葡萄牙在印度殖民地果阿的援軍趕到，成功擊敗了柔佛軍隊，同時也摧毀了柔佛首都，使柔佛實力元氣大傷。出逃的柔佛蘇丹阿都查利，利雅沙（Abdul Kalil Riayat Shah）在逃亡期間逝世，其子阿拉烏丁三世即位後，在峇株沙瓦（Batu Sawar）建立首都。