交通部回應，指揮中心規劃入境人數，每週2.5萬人為上限，依各航空公司，實際飛航載客情形，及規劃航班，計算各航空公司，獲配每週入境旅客總人數上限，要求各航空公司，如訂位已超過額度，應停止銷售。

指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞：「交通部會做評估之後，再來跟我們指揮中心提報會跟他們討論，現在才剛上路限制2.5萬，短時間應該不會做調整，如果(採檢量能)能夠做得到，能夠提升更多我們也不反對。」

交通部次長陳彥伯指出，總量管制後有發現有些航空公司訂位有超過分配額度的情形，這部分，民航局已經積極協調相關業者，大概採取幾項作法，首先是請航空公司請旅客遞延訂位，有超額就請暫時停止銷售。並且，民航局會協調，如果有某些訂位數額已逾分配數，會協調滾動調整配額分配。