臨床上中醫常使用「針灸」和「中藥」來治療腦中風後遺症。利用針灸刺激人體穴位，可促進神經修復，改善身體活動功能，加上中藥針對體質調理。國內外許多研究表示，復健搭配「針灸治療」可以改善腦中風患者的認知能力、肢體運動功能障礙及其後遺症，並可降低腦中風再復發機率。

針灸治療可分為「頭皮針」與「體針」。頭皮針是將針刺頭部穴位，可以刺激大腦皮質反射區域，改善局部循環，加速復原。體針的部分主要是在四肢穴位做刺激，使肌肉張力維持平衡，讓肌肉不會張力過大導致攣縮，或肌肉張力不足而致肌肉無力。