大多數的兒童便秘屬於功能性便秘，少數是因為腸道神經發育不良而引起蠕動障礙所產生的便秘。一般來說，不同年齡層的排便次數不同，依照兒童的便秘診斷，家長可以留意兒童是否有以下其中兩項的症狀並有持續一個月以上：一週排便少於2次、一週大於一次的滲便、有過憋住大便的姿勢或意圖、排便疼痛或困難、有直徑過於粗大(可能阻塞馬桶)的糞便。