八月初二日（1368年9月14日），明朝軍隊從大都的齊化門攻城而入，元朝正式退出中原，回到北方草原，史稱北元。八月初四日（1368年9月16日），元順帝到達上都。至正二十九年六月十三日（1369年7月16日），明軍逼近上都，元順帝離開上都，當天到達應昌。六月十七日（1369年7月20日），明軍將領常遇春攻克上都。元順帝在上都和應昌曾兩次組織兵力試圖收復大都，但都被明朝軍隊擊敗