石峁遺址的內外城城牆為石砌而成，殘存城牆約3米高。內城面積210萬平方米，依山勢呈東北—西南分布，現存城牆殘長2公里。外城為將內城東南城牆向東南方向擴築而成，殘長2.84千米，面積425萬平方米。這一面積超過了良渚遺址（300多萬平方米）和陶寺遺址（270萬平方米）等城址，位列同時期已發現城址面積之最