2005年8月16日，與印尼政府達成協議，以解除武裝組織，換取印尼政府的特赦，以及不在亞齊駐紮非亞齊裔軍人，從而結束長達30年的武裝鬥爭。12月20日，「自由亞齊運動」向印尼政府上繳最後一批武器，從而徹底完成繳械行動。12月29日，印尼根據和平協議從亞齊省撤出最後一批部隊