1960年以後，四水六崗衛教軍仍在尼泊爾北部的木斯塘堅持對抗中國人民解放軍的游擊戰，時常襲擾西藏邊境地區。中情局特工約翰·肯尼思·諾斯（英語：John Kenneth Knaus）表示，中情局支持衛教軍最大的情報收穫，來自1961年10月25日對解放軍車隊的襲擊，衛教軍40餘人騎馬襲擊解放軍西藏軍區邊防5團盛永琛副團長帶領的一個加強班，全殲解放軍11人，獲得1,500件檔案，其中包括大躍進失敗的確切證據以及解放軍戰鬥序列。其他情報收穫包括1962年獲得中國導彈計畫與發展原子彈的情報，以及在1964年埋下探測器，成為美國證實中國在羅布泊進行原子彈試爆的最早來源。1972年美國總統尼克森訪華，中美關係改善，之後美國政府和中情局停止援助四水六崗衛教軍。