菜寮溪流域地層橫跨多個地質時期，出土化石不計其數，包括左鎮人頭蓋骨、早坂犀、猛獁象等，此外，當地同時出土海相與陸相化石，包括貝類、珊瑚、魚類等海洋生物化石，以及象類、鹿類等已滅絕大型哺乳動物化石，這些發現不僅是研究台灣古氣候與地形變遷重要證據，也見證數百萬年間的地質與環境劇變。