2020年3月，對於2019冠狀病毒病疫情在全球擴散，秘魯政府於16日宣布進入國家緊急狀態，限制人民行動與民用航空起降，導致約150名臺灣旅客滯留秘魯無法出境。駐秘魯臺北經濟文化辦事處協調秘魯外交部、秘魯軍方、秘魯南美航空與臺灣雄獅旅行社，在取得飛行許可後，首架包機將72名臺灣旅客送離秘魯。至於第2架包機則考量滯留的臺灣旅客人數有限，單獨包機成本過高，於是由辦事處主導，和日本、新加坡與馬來西亞駐秘魯使領館合作，共搭載臺灣55名、美國34名、日本29名、新加坡14名與馬來西亞7名滯留旅客，抵達美國邁阿密後各自轉機返國，另有22名臺灣旅客因不同原因留在秘魯。辦事處並感謝秘魯政府再次優先核准臺灣的包機飛行權