牛稠子遺址的生態遺留多屬於潮間帶的貝種，因此可以推斷距離海岸線應不致太遠。工具方面出土石器以開墾用斧鋤形器數量最多，也有少量石刀等收割用具。大量的打剝石片、磨石器等顯示石器加工應是在當地進行。陶器工藝高度發展，質地主要以紅褐色陶，大部分夾砂，少部分為泥質陶。橄欖石玄武岩製成的斧鋤形器、犁形器的出土顯示與澎湖之間有著密切的相關性