牛稠子遺址屬於砂質堆積透水性佳，保存環境不佳，有機性遺物難以保存下來。惟一定年資料為1976年試掘所得之貝塚中之貝殼標本，測得的原始定年資料來為3525±70B.P. 偏牛稠子文化晚期。根據南科園區內的考古資料，牛稠子文化大致可區分為鎖港期（距今約4,200-3,800年）、以及牛稠子期（距今約3,800-3,300年）。另外牛稠子遺址的文化層平均厚約50公分，最厚文化層可達100公分，相較於前時期大坌坑文化的遺址聚落規模更大，這顯示了人群長期居住於此地。