神戶市屬於瀨戶內海式氣候區域，全年氣候較為溫和。六甲山地北側的地區則具有內陸型氣候的特徵，和市區相比有較大的溫差。和日本其他地區相比，神戶的降雨相對較少，全年平均降水量約在1,200毫米。櫻花盛開的春季是神戶最為宜人的季節。在經過潮濕的梅雨季節之後，神戶進入炎熱的夏季。由於神戶空氣較為乾燥且有海風吹拂，使得神戶的夏季雖然炎熱，但相對近畿地方其他大都市而言白天仍較為舒適。在夏秋之交的時節，神戶有時會受到颱風的影響。神戶的秋季頗為短暫。而冬季的神戶則由於山地地形的影響，常有被稱為六甲颪的季節風吹襲。雖然由於六甲颪的影響使得神戶冬季氣溫較低，然而因冬季空氣乾燥使得神戶市區少有降雪。