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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:01 PM
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在噗浪寫一些雜談還是有好處的
至少不會被點閱數影響心情😆不過我只是想寫我自己寫的
就當作廣發的日記隨意寫寫吧
今天要分享的是,我在博班發表的第二篇
於2020年,發表在Journal of Molecular Medicine
Treatment of murine colitis by Saccharomyces boulard...
這間期刊在我們投稿被接受的那年是Q2,今年看看已經變成Q1了
感覺我的指導老師,其實還蠻會選期刊的?😆
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:02 PM
這篇的重點:
。我們成功證明了Easy clone multi酵母質體更適合作為益生酵母S. boulardii (布拉酵母)基因改造的載體,並且使其分泌ANP以緩減腸道發炎的症狀
這篇的背景:
。作為益生菌,布拉酵母已知可以改善腸道菌相以及減緩腸道發炎反應,這使得布拉酵母菌具有作為釋放藥物平台的潛力
。Easy clone multi跟Easy clone2.0都是作為釀酒酵母(S. cerevisiae)基改的平台,但是對於布拉酵母的基改研究相對較少
。心鈉肽(Atrial natriuretic peptide, ANP)主要已知跟心臟調節血壓相關,最近的文獻也報導了其免疫調節的功能
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:02 PM
這篇的發現:
。我們成功建立了提高布拉酵母基改效率的方法,這將有利於布拉酵母在學術以及工業化的發展
。作為其中一個應用,我們證明分泌ANP的布拉酵母有益於改善由DSS造成的腸道潰瘍
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:03 PM
雜談:
在做這篇研究前,對於酵母只有模糊的印象
大概最多就是yeast two hybrid🤣
某天,我的指導老師跑來問我:你有做過酵母的經驗嗎?
我一方面跟老師說沒有
另一面心頭一驚,我內心立馬想到該不會要做yeast two hybrid吧🤣
是不是開始要研究這個技術了wwww
不過老師聽到我的回答,很開心的說
我也沒有做過🤣我們就一起來研究吧~
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:03 PM
跟養菌不大一樣,酵母在培養基上長的比較慢
通常要等個兩三天才會形成菌落,不過眼睛夠給力的話
是可以在隔天看到一些迷你菌落,然後就可以提前規劃策略😆
酵母養出來也有一種香味,跟養菌不同
也因為養出來的味道不一樣,如果有污染,其實是可以用鼻子聞出來的w
一個小題外話,除了我以外,其他人做的都是釀酒酵母的研究
這大概也是一種分散風險吧😆
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:03 PM
當初其實有找布拉酵母基改的文獻,不過那時候找到的文獻不大多
嘗試了他們的做法後,發現在我的實驗裡
雖然可以得到一些菌落,但是基改的效率並不是很好
在做了很多次嘗試後,我觀察自己的實驗數據
發現到一些關聯性,做了一些條件的嘗試後
終於可以大幅增加布拉酵母的轉殖效率
順帶一提,這些基改的方法,在使用釀酒酵母當作載體時
基改的效率非常好👍果然雖然都是酵母,轉出來的效率還是天差地別呀
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:04 PM
一開始這篇研究的賣點
其實不是想要做提升基改效率的題目😆
我們原本打算做出可以當作保健食品賣專利的基改酵母
不過大概是我的know how還不足吧
即便我們做了相當多嘗試,但仍舊無法讓腸道潰瘍的小鼠
經由我們的酵母治療後,達到完全痊癒的效果
我跟老師討論,甚至還在想是不是因為胃酸的關係
導致基改酵母的效力降低
於是我還跑去做了酵母果凍然後喂給腸道潰瘍的小鼠🤣
那些果凍還是顆粒狀,可以讓小鼠喝下去程度大小的果凍
不過最後還是沒有達到我們最終希望的效果🫠 只有減緩潰瘍的成效而已
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:04 PM
當初我跟老師討論投稿的時候,也蠻有趣的
老師那時候跟我說,他覺得可以把這個研究停住發表了
不過那時候其實我也蠻苦惱的,因為動物實驗的結果
對於我跟老師來說都不算漂亮(雖然有拿到顯著差異的結果)
我把我的擔憂跟老師說之後,他也沒有說什麼就回去想想了
後來我自己在想,如果真的要發
可以從哪個角度出發?想著想著,我就想到了我們先前發表的第一篇著作
從技術面上來看,我覺得我們還是可以寫出些什麼
後來老師跑來跟我說,他想不到有什麼發表的理由時
我就把我的想法說給他聽,他想了一想
只說了句:噢,那我們的故事要全部重新改寫排版一輪 於是就投出了這一篇論文
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:04 PM
其實因為第一篇投稿的陰影,我其實後來都覺得
有拿到revise都不應該要開心,只有拿到accepted才算是真的開心
不過還好這篇很順利的一次就接到revise然後順利的accepted
老師後來有點打趣的說,這篇有點撿到😆
(這樣說算是好的嗎……🤔)
不過就結果來說,我可能在這裡就拿到了兩張畢業門票
雖然老師那時候說,這兩篇不會是我的畢業論文
那時候我自己想想也覺得還合理吧,雖說IF並不是那麼重要
但是在追求IF的台灣,應該還是要發一篇high IF當作我的畢業代表作才行
於是之後就要講第三篇,也就是最後一篇我的畢業論文了😆希望不會拖得太久🤪
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@victor0906
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Sun, Oct 20, 2024 3:06 PM
小小的題外話,有點在猶豫在寫最後一篇代表作之前
要不要寫個我自己身為第三作者的論文雜談🤔
雖然篇幅或許不會太多就是了
載入新的回覆
至少不會被點閱數影響心情😆不過我只是想寫我自己寫的
就當作廣發的日記隨意寫寫吧
今天要分享的是,我在博班發表的第二篇
於2020年,發表在Journal of Molecular Medicine
這間期刊在我們投稿被接受的那年是Q2,今年看看已經變成Q1了
感覺我的指導老師,其實還蠻會選期刊的?😆
。我們成功證明了Easy clone multi酵母質體更適合作為益生酵母S. boulardii (布拉酵母)基因改造的載體,並且使其分泌ANP以緩減腸道發炎的症狀
這篇的背景:
。作為益生菌,布拉酵母已知可以改善腸道菌相以及減緩腸道發炎反應,這使得布拉酵母菌具有作為釋放藥物平台的潛力
。Easy clone multi跟Easy clone2.0都是作為釀酒酵母(S. cerevisiae)基改的平台,但是對於布拉酵母的基改研究相對較少
。心鈉肽(Atrial natriuretic peptide, ANP)主要已知跟心臟調節血壓相關,最近的文獻也報導了其免疫調節的功能
。我們成功建立了提高布拉酵母基改效率的方法,這將有利於布拉酵母在學術以及工業化的發展
。作為其中一個應用,我們證明分泌ANP的布拉酵母有益於改善由DSS造成的腸道潰瘍
在做這篇研究前,對於酵母只有模糊的印象
大概最多就是yeast two hybrid🤣
某天,我的指導老師跑來問我:你有做過酵母的經驗嗎?
我一方面跟老師說沒有
另一面心頭一驚,我內心立馬想到該不會要做yeast two hybrid吧🤣
是不是開始要研究這個技術了wwww
不過老師聽到我的回答,很開心的說
我也沒有做過🤣我們就一起來研究吧~
通常要等個兩三天才會形成菌落,不過眼睛夠給力的話
是可以在隔天看到一些迷你菌落,然後就可以提前規劃策略😆
酵母養出來也有一種香味,跟養菌不同
也因為養出來的味道不一樣,如果有污染,其實是可以用鼻子聞出來的w
一個小題外話,除了我以外,其他人做的都是釀酒酵母的研究
這大概也是一種分散風險吧😆
嘗試了他們的做法後,發現在我的實驗裡
雖然可以得到一些菌落,但是基改的效率並不是很好
在做了很多次嘗試後,我觀察自己的實驗數據
發現到一些關聯性,做了一些條件的嘗試後
終於可以大幅增加布拉酵母的轉殖效率
順帶一提,這些基改的方法,在使用釀酒酵母當作載體時
基改的效率非常好👍果然雖然都是酵母,轉出來的效率還是天差地別呀
其實不是想要做提升基改效率的題目😆
我們原本打算做出可以當作保健食品賣專利的基改酵母
不過大概是我的know how還不足吧
即便我們做了相當多嘗試,但仍舊無法讓腸道潰瘍的小鼠
經由我們的酵母治療後,達到完全痊癒的效果
我跟老師討論,甚至還在想是不是因為胃酸的關係
導致基改酵母的效力降低
於是我還跑去做了酵母果凍然後喂給腸道潰瘍的小鼠🤣
那些果凍還是顆粒狀,可以讓小鼠喝下去程度大小的果凍
不過最後還是沒有達到我們最終希望的效果🫠 只有減緩潰瘍的成效而已
老師那時候跟我說,他覺得可以把這個研究停住發表了
不過那時候其實我也蠻苦惱的,因為動物實驗的結果
對於我跟老師來說都不算漂亮(雖然有拿到顯著差異的結果)
我把我的擔憂跟老師說之後,他也沒有說什麼就回去想想了
後來我自己在想,如果真的要發
可以從哪個角度出發?想著想著,我就想到了我們先前發表的第一篇著作
從技術面上來看,我覺得我們還是可以寫出些什麼
後來老師跑來跟我說,他想不到有什麼發表的理由時
我就把我的想法說給他聽,他想了一想
只說了句:噢,那我們的故事要全部重新改寫排版一輪 於是就投出了這一篇論文
有拿到revise都不應該要開心,只有拿到accepted才算是真的開心
不過還好這篇很順利的一次就接到revise然後順利的accepted
老師後來有點打趣的說,這篇有點撿到😆
(這樣說算是好的嗎……🤔)
不過就結果來說,我可能在這裡就拿到了兩張畢業門票
雖然老師那時候說,這兩篇不會是我的畢業論文
那時候我自己想想也覺得還合理吧,雖說IF並不是那麼重要
但是在追求IF的台灣,應該還是要發一篇high IF當作我的畢業代表作才行
於是之後就要講第三篇,也就是最後一篇我的畢業論文了😆希望不會拖得太久🤪
要不要寫個我自己身為第三作者的論文雜談🤔
雖然篇幅或許不會太多就是了