宋高宗與之前的宋朝皇帝一樣，本來就十分懼怕地方武力和將領擁兵坐大，這次的政變成了他心中揮之不去的陰影，使他終其一生都不再信任武將。他頻繁調度將領，達到「兵不識將，將不識兵」的目的，使南宋重文輕武的情形加劇。苗傅拿「徽欽」二帝仍在北方來質疑高宗皇位的正統性，以此為主要理由要求高宗退位，加深了高宗對軍人專權及失去皇位的恐懼，但因局勢不穩及金兵的威脅下，高宗仍需要武將以對抗金兵的威脅，主戰派及主和派在朝中形成均勢，直至定都杭州及高宗任用秦檜為止。