一、無視高達7成5的民意反對萊豬進口，吳秀梅跳到第一線力挺，不以民眾的食安為念，後來爆發進口蛋及美豬洗產地的問題，民眾才驚覺邊境檢驗的空洞。
二、高端疫苗送檢8成不合格被退，吳秀梅稱「不代表不合格，搞不好是更好的產品」，如此脫序言論讓人訝異。
三、疫情期間，吳秀梅被爆運用特權，將周邊與她扯上關係的非一線人員都納入優先施打名單，所以食藥署的施打率是169％。
四、黑心快篩事件爭議，朝野嚴厲批判食藥署的失職，吳秀梅脫口「應該去怪廠商」。
五、蘇丹紅事件，食藥署一年前早就接獲檢舉，不肖廠商利用邊境管制的漏洞進口，但失能又失職的官僚體系，沒有積極有效管控。
六、爆發輸液缺貨嚴重，吳秀梅回應卻雲淡風輕、事不關己，稱「醫療院所輸液足夠，沒有一家缺貨」。