愛媛大學創立於1949年，是愛媛縣唯一的國立大學，擁有超過9000學生。現在愛媛大學共有7個學院，除了醫學院和附屬醫院之外的各學院均位於松山市，醫學院則位於東溫市。愛媛縣立醫療技術大學是愛媛縣唯一的公立大學。愛媛縣主要的私立大學則有松山大學、聖凱瑟琳大學，均位於松山市