葡萄糖胺可能影響藥物的效果，如抗凝血藥物warfarin，若併用葡萄糖胺可能會使藥物效果增強，延長凝血時間，提高出血風險。葡萄糖胺也可能影響部分抗癌藥物（etopaside、teniposide、doxorubicin）及降血糖藥物之成效。