之後笨北港原地發展成為今日之北港鎮，笨南港則因接下來的林爽文事件及笨港溪水氾濫，使笨南港據民再次遷移至東南方的「麻園寮」，改稱「新南港」，至清末易名「新港」。笨南港舊街市則改稱「舊南港」（今新港鄉南港村），雖已因街市遷移而沒落，但今日尚留有不少當年舊跡。