獸孔目由三個主要的演化支組成，恐頭獸亞目、草食性的異齒亞目、還有大多是肉食性的獸齒類，而肉食性的巴莫鱷亞目是個原始物種的並系群集合。在一陣短期的多樣性輻射演化後，恐頭獸亞目在二疊紀中期（瓜達鹿白階晚期）消失，但異齒亞目的二齒獸類與獸齒類的麗齒獸類與獸頭類開始繁盛。在二疊紀末期，第一批犬齒獸類也出現