克拉通的下部是可以與岩石圈相對應的不規則的冷地函，其厚度是成熟大洋岩石圈或非克拉通的大陸岩石圈的厚度（大約100公里）的兩倍。在這樣的深度上，可以說一些克拉通實際上是紮根於軟流圈之上的。因為克拉通具有中性或正的浮力，所以它和地函根的化學組成必然不同，而且為了抵消因地熱收縮造成的密度增加，克拉通還具有較低的內部密度。