整體來說，科拉半島遭受嚴重的生態傷害，主要是軍事（尤其是海事）生產以及工業開採磷灰石所造成的污染。大約有250座蘇聯軍方生產的核反應爐遺留在半島上，雖然已不再使用，但這些核反應爐仍然產生輻射及漏出放射性廢料。