克塞山戰役的失敗，直接導致了塞爾柱政權的衰落與瓦解，並使安納托利亞地區陷入一段長時間的混亂時期，除此之外，特拉比松帝國與位於奇里乞亞的奇里乞亞亞美尼亞王國也因為此戰的影響，兩國皆成為蒙古帝國的附庸國，蒙古人實質統治了安納托利亞