蒙兀兒人所指是居住於東察合台汗國的蒙古人，蒙兀兒斯坦的意思即是蒙古人之地方。所指為北到塔爾巴哈台，西至伊塞克湖，巴爾喀什湖，東至阿爾泰山，南至畏兀兒的綠洲。基本上天山以北整個新疆北部，楚河與塔拉斯以及費爾干納谷地也算是蒙兀兒斯坦（即是哈薩克與吉爾吉斯）。一般察合台汗國分為分為畏兀兒斯坦（Uyghurstan），阿爾蒂沙爾(Alti-Shahr，意思是六城：莎車，喀什，和田，阿克蘇，烏什和英吉沙），和西部蒙兀兒斯坦（Moghulistan）。