統治者死亡後王位爭奪的情況相當頻繁，卜撒因曾短暫統一，但死後國家又處於分裂狀態。1506年，帝國亡於突厥烏茲別克人部落。其後裔巴布爾轉而去印度次大陸開創了莫臥兒帝國，至第六代皇帝奧朗則布去世後開始衰敗。1857年，末任皇帝巴哈杜爾沙二世被東印度公司罷黜，莫臥兒帝國滅亡。帖木兒帝國和莫臥兒帝國皆由帖木兒王朝統治。