同時進行的摩洛叛亂為新人民軍的發展創造了有利條件。在20世紀70年代，儘管政府和摩洛伊斯蘭解放陣線於1976年達成了和平協議，但是75%的菲律賓武裝部隊仍繼續部署在摩洛島。截至2000年，有40%的菲律賓武裝部隊繼續與摩洛叛軍交戰。