在明治新政府統治下，士族失去特權為生活所苦，對新政府的不滿情緒越發高漲，引發了日本史上最後一次的武裝暴動──西南戰爭。西南戰爭在失去領袖西鄉隆盛後結束了武力動亂，朝自由民權運動的方向轉變。廢藩置縣進行得不徹底的鹿兒島最終降服於新政府，是具象徵性的事件，意味著舊體制的轉換遍及全國各地。