經過與小行星132524 APL一個短暫的相遇後，新視野號飛往木星，在2007年2月28日使得其最接近木星的距離為2.3 × 10^6公里。木星飛掠提供重力助推給新視野號的速度增加了4 km/s（14,000 km/h）。木星相遇也被用來作為新視野號科技性能的全面測試，傳回關於行星的大氣層，衛星和磁層的數據。在飛掠木星後，探測器繼續前往冥王星。在木星後的大部分旅行中，太空飛行器是處於休眠模式度過，以保護太空飛行器上的系統。在2006年9月，新視野號第一次拍攝了冥王星，其次是在2013年7月拍攝了區分冥王星和它的衛星冥衛一作為兩個單獨的對象的圖像。無線電信號從新視野號太空飛行器旅行到地球需要用4個多小時。