皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:17 PM
1
今天來破解這個
武漢肺炎》病毒源頭罪證確鑿? 美學者:人造且來自實驗室 - 國際 - 自由時報電子報
掰噗~
@baipu
說
Tue, Feb 18, 2020 2:17 PM
不會吧?
Swablu 青綿
@Swablu0416
Tue, Feb 18, 2020 2:18 PM
加油
厭世/詭域魂音/負面情緒
@angelaliang12
Tue, Feb 18, 2020 2:19 PM
坐等
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:21 PM
首先
這東西的原文來自於這裡
On the Origins of the 2019-nCoV Virus, Wuhan, China
看得懂英文的應該就直接破解了
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:24 PM
這邊先解釋一下
生物研究常利用一種叫plasmid的載體
可以幫助我們把想要表現的基因送到細胞、細菌之類的微生物裡
所以plasmid序列被發現在病毒裡等於是直接的人工證據
接下來解釋為什麼不是
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:34 PM
這篇文章說在SARS-CoV-2(2019-nCoV,武漢肺炎病毒,新型冠狀病毒...隨便啦)裡發現了使用P-Shuttle SN Vector這個plasmid的痕跡
說是找到人工序列
但這個plasmid的某一段序列與SARS-CoV-2(武漢肺炎病毒)的某一段序列也只有67%相似
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:35 PM
附上原文截圖
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:37 PM
而且這個plasmid序列拿去blast
會找到一堆SARS病毒的某一段跟它有99%相似
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:39 PM
而且仔細點進去看會發現都是對到同一段
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:46 PM
至於為什麼呢
去查查它提到的pShuttle這個plasmid (原文有提供)
Expression vector pShuttle-SN, complete sequence - N...
就會發現他本來就是個表現了少了S1 subunit的 SARS S protein的載體
所以會相似也是當然的xD(67%很不相似了
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:51 PM
拿一個裡面有SARS序列的plasmid
去比對SARS-CoV-2
那當然會對到相似的啊廢話xDD
就是SARS那一段被對到啊xD
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 2:56 PM
然後要說把SARS S protein接過去
這個67%也是低到不行
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 3:00 PM
而且原文中的作者James Lyons-Weiler也於2/9改變說法了
表示在仔細研究後排除了實驗室重組病毒的可能性
就在原文的最上面
但自由時報卻2/17還在引用當時作者弄錯的說法
就像愛滋病毒那篇論文都撤回了還一直被提來證明陰謀論一樣
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Tue, Feb 18, 2020 3:08 PM
Swablu 青綿
:
厭世/詭域魂音/負面情緒
: 同行歡迎補充勘誤!xD
Swablu 青綿
@Swablu0416
Tue, Feb 18, 2020 3:18 PM
皮卡 PIKA
: 我只有大三修生物化學過..已經很遠了,專攻是在作物栽培
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Wed, Feb 19, 2020 4:25 AM
昨天後來趕著跑去洗洗睡了
晚點再補充一些說明(X
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Wed, Feb 19, 2020 11:37 AM
補充說一下
作者原本以為pShuttle-SN是在1998年出現的東西
然後因為裡面的序列跟SARS S protein很相近
因此2008年被用來作為研究疫苗用
而SARS-CoV-2有一段1378bp的獨特序列跟這個pShuttle-SN有67%相似
所以認為這是阿共研究SARS疫苗的產物
但事實上是
pShuttle這個載體是在1998年發表的
而在2005年才建構出帶有 SARS S protein的pShuttle-SN
而這個67%像就是像在SARS S protein的部份
並非載體本身
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Wed, Feb 19, 2020 11:37 AM
用單純的pShuttle載體去跟這個1378bp序列比對
Addgene pShuttle Sequencing Result - Sequence Analyz...
會出現這樣的結果
而要說是用這個pShuttle-SN合成病毒
要知道平常接clone或是抽完plasmid去定序
要是對出來有任何一個洞或是突變就得打掉重練的
用這個pShuttle-SN卻只有67%像是完全不可能的
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Wed, Feb 19, 2020 1:02 PM
剛剛發現要找到小片段相似應該要選另一個選項
補上pShuttle-SN跟SARS-CoV-2之間的序列比對
僅67%相似
而pShuttle與SARS-CoV-2的序列比對
就是零零落落對到了幾段
這幾段在SARS-CoV2上的位置也不在剛剛對到67%的那段
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Wed, Feb 19, 2020 2:05 PM
話說這樣會不會有點亂
我後來有重新排版過
不過不知道怎麼貼
我記得以前有plurk paste的功能可以貼很多字?
cosmathane
@cwg
說
Fri, Feb 28, 2020 12:08 PM
這時候才知道英文多重要
,
然後拿起書啃了五分鐘。
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Fri, Feb 28, 2020 2:14 PM
cosmathane
: 其實我英文也很爛
但是閱讀還行
cosmathane
@cwg
說
Fri, Feb 28, 2020 2:16 PM
從大學畢業後對英文反胃到今天
Swablu 青綿
@Swablu0416
Fri, Feb 28, 2020 4:54 PM
應該沒人英文比我爛XD 日聽可能都還比較好
皮卡 PIKA
@xPIKAx
Sat, Feb 29, 2020 6:30 AM
我的英聽跟口說都超爛的
到外國變啞巴的那種
雖然我覺得另一個原因是我本來就不擅於跟人面對面交談,在台灣人家也以為我啞巴
Swablu 青綿
@Swablu0416
Sat, Feb 29, 2020 9:56 AM
那皮卡跟我超像的XDD 不過近年來我在網路上有越來越少言的趨勢
所以相對而言,現實交談的比例是有變比較多
cosmathane
@cwg
說
Sat, Feb 29, 2020 11:07 AM
英文其實不是很好練......跟中文是完全不同的語系。
載入新的回覆
這東西的原文來自於這裡
看得懂英文的應該就直接破解了生物研究常利用一種叫plasmid的載體
可以幫助我們把想要表現的基因送到細胞、細菌之類的微生物裡
所以plasmid序列被發現在病毒裡等於是直接的人工證據
接下來解釋為什麼不是
說是找到人工序列
但這個plasmid的某一段序列與SARS-CoV-2(武漢肺炎病毒)的某一段序列也只有67%相似
會找到一堆SARS病毒的某一段跟它有99%相似
而且仔細點進去看會發現都是對到同一段
去查查它提到的pShuttle這個plasmid (原文有提供)
Expression vector pShuttle-SN, complete sequence - N...
就會發現他本來就是個表現了少了S1 subunit的 SARS S protein的載體
所以會相似也是當然的xD(67%很不相似了
去比對SARS-CoV-2
那當然會對到相似的啊廢話xDD
就是SARS那一段被對到啊xD
這個67%也是低到不行
表示在仔細研究後排除了實驗室重組病毒的可能性
就在原文的最上面
但自由時報卻2/17還在引用當時作者弄錯的說法
就像愛滋病毒那篇論文都撤回了還一直被提來證明陰謀論一樣
晚點再補充一些說明(X
作者原本以為pShuttle-SN是在1998年出現的東西
然後因為裡面的序列跟SARS S protein很相近
因此2008年被用來作為研究疫苗用
而SARS-CoV-2有一段1378bp的獨特序列跟這個pShuttle-SN有67%相似
所以認為這是阿共研究SARS疫苗的產物
但事實上是
pShuttle這個載體是在1998年發表的
而在2005年才建構出帶有 SARS S protein的pShuttle-SN
而這個67%像就是像在SARS S protein的部份
並非載體本身
Addgene pShuttle Sequencing Result - Sequence Analyz...
會出現這樣的結果
而要說是用這個pShuttle-SN合成病毒
要知道平常接clone或是抽完plasmid去定序
要是對出來有任何一個洞或是突變就得打掉重練的
用這個pShuttle-SN卻只有67%像是完全不可能的
補上pShuttle-SN跟SARS-CoV-2之間的序列比對
僅67%相似
而pShuttle與SARS-CoV-2的序列比對
就是零零落落對到了幾段
這幾段在SARS-CoV2上的位置也不在剛剛對到67%的那段
我後來有重新排版過
不過不知道怎麼貼
我記得以前有plurk paste的功能可以貼很多字?
這時候才知道英文多重要,然後拿起書啃了五分鐘。但是閱讀還行
從大學畢業後對英文反胃到今天到外國變啞巴的那種
雖然我覺得另一個原因是我本來就不擅於跟人面對面交談,在台灣人家也以為我啞巴所以相對而言,現實交談的比例是有變比較多