艾爾多安任內一直致力加強和中國的關係，不過土耳其被指包庇縱容東突分裂分子，更容許多個東突組織在土耳其活動. 艾爾多安指責中國對維吾爾人進行種族滅絕. 2012年4月8至11日，艾爾多安對中國進行為期4天的訪問。這是27年來土耳其總理首次訪問中國，也是土耳其總理首次訪問中國新疆維吾爾族自治區