日韓兩國間還有獨島爭議（日本人稱為竹島），兩國互稱對獨島有管轄權。南韓前總統李明博曾經登上獨島，引發日本政府不滿。之前，日韓兩國還有慰安婦爭議。這個問題在美國外交斡旋下，安倍與南韓前總統朴槿惠已簽署「日韓慰安婦協議」，雙方同意慰安婦問題達成最終且不可逆的解決。