政權在第二代胡馬雍時期曾一度衰落，後在第三代皇帝阿克巴時期進入全盛時期。自第三任皇帝阿克巴一直到第六任奧朗則布統治時期是蒙兀兒帝國的全盛時期，帝國的疆域經過逐步的擴張而達頂峰，經濟繁榮。奧朗則布去世後，蒙兀兒帝國的社會經濟發展江河日下，並馬拉地帝國崛起，續漸被大英帝國的東印度公司所掌控。1857年，印度民族起義爆發之後，英國擊潰起義的印度兵團，並徹底廢除已經有名無實的帝國，直接統治印度，開始百年的殖民統治。